Osim što pomažu kod problema sa varenjem, nadutošću, dijarejom i opstipacijom, stručnjaci veruju i da probiotici jačaju naš imuni sistem i smanjuju simptome intolerancije na pojedine namirnice. Još neka povoljna dejstva probiotika uključuju i regulaciju holesterola i krvnog pritiska, održavanje zdrave vaginalne flore, i pomoć kod inflamatornih bolesti creva, gojaznosti i dijabetesa tipa 2. Pojedine studije potvrdile su da uzimanje probiotika može da ublaži i simptome sindroma iritabilnog kolona.