Naravno da pankreas, kao i svaku drugi organ, može oboleti od raznih oboljenja. Najčešća, pak, patologija je pankreatitis ili akutna upala pankreasa. Pankreatitis je zapaljensko oboljenje nastalo usled visokoh pritiska u pankreasnim duktusima, tj konzumiranjem alkohola ili usled postojanja kamena u žuči.Pankreas može oboleti i od tumora, retko ali uvek mrtonosan. Diabetes melitus, tip 1, koji se karakteriše stvaranjem antitela na same ćelije pankreasa kao da su neprijatelji.