Većina simptoma SIDE nisu direktno izazvani samim delovanjem virusa, kao kod drugih oboljenja. Virus napada odbrambene snage, imuni sistem organizma i slabe ga do te mere da organizam postaje podložan svim infekcijama. Javljaju se groznica, kaliranje telesne mase, umor, dijareja, problemi sa gutanjem hrane, bol u grlu. Sve infekcije zahtevaju lečenje jer mogu dovesti do komplikovanja i čak smrtnog ishoda.