Generalizovane infekcije organizma koksaki virusom se mogu u velikom obimu zakomplikovati ukoliko se ne dijagnostikuju na vreme i ne leče adekvatno. Kada se potvrdi pa postojanje koksaki virusa u organizmu, kombinaciju terapije određuje tim lekara koji se udružuje na osnovu toga gde se infekcija u organizmu pojavila. Terapija je simptomatska i u pitanju je kombinacija vitaminske, antipiretične terapije, terapije bola i kortikosteroidna terapija.