Kada se redovno unosi u količini preko 400 mcg (što je količina koju unesete u samo 5-6 brazilskih oraha), selen može da bude toksičan po naš organizam. Neki od simptoma koji se mogu javiti jesu opadanje kose, umor, vrtoglavica, mučnina i nervna oštećenja. Postoje istraživanja koja su pokazala da visok unos selena može da utiče na pojavu određenog tipa raka kože. Isto tako je povećan rizik od dijabetesa tipa II pri dnevnim dozama od 200 mcg.