Treća grupa humanih hormona su proteini, peptidni hormoni koji nastaju iz amino kiselina. Neki od peptidnih hormona su kalcitonin, vazopresin, gonadotropin, hormon rasta, leptin, insulin, motilin, sekretin, renin, prolaktin, oksitocin i dr. Hormoni iz grupe peptidnih hormona regulišu zaista veliki broj funkcija u organizmu. Neke od njih su menstrualni ciklus, regulacija apetita, regulisanje procesa varenja i enzima koji vrše varenje hrane, laktaciju kod dojilja.