Kada se redovno unosi u količini preko 400 mcg (što je količina koju unesete u samo 5-6 brazilskih oraha), selen može da bude toksičan po naš organizam. Neki od simptoma koji se mogu javiti jesu opadanje kose, umor, vrtoglavica, mučnina i nervna oštećenja. Postoje istraživanja koja su pokazala da visok unos selena može da utiče na pojavu određenog tipa raka kože. Isto tako je povećan rizik od dijabetesa tipa 2 pri dnevnim dozama od 200 mcg.