Još jedna karakteristika grejpfruta i soka od grejpfruta, ali ovaj put ne tako dobra, jeste njegova interakcija sa velikim brojem lekova. Određena jedinjenja u grejpfrutu zaustavljaju aktivnost enzima pomoću kojeg se metaboliše više od 100 medikamenata. Usled ovoga lek prelazi direktno u krvotok, dolazi do povišenja njegove koncentracije u krvi i do predoziranosti tim lekom. Samo 2,5 dl soka od grejpfruta dovoljno je da se izazove ova neželjena interakcija. U lekove koji obično interaguju sa grejpfrutom spadaju pojedini antibiotici, medikamenti za smanjivanje holesterola, lekovi za srce, lekovi za smirenje i analgetici.