Proteini kao što su jaja, meso, pasulj, se sastoje od velikih molekula i za njihovo varenje tj. razgradnju treba više vremena. Dok se varenje ugljenih hidrata završi u želudcu, proteini se vare i u tankom crevu gde se molekuli proteina cepaju do nivoa amino kiselina. Masti su molekuli sa najvećom količinom energije koji moćemo pojesti. Masti se isto tako vare u tankom crevu, gde se masti razlažu do nivoa tečnosti i tu, u tankom crevu se odvajaju masne kiseline i holesterol uz pomoć dejstva žuči i pankreasnih sokova za varenje.
