U najnovijim istraživanjima infekcija heliko bakterijom se povezuje sa mnogim autoimunim oboljenjima, dijabetesom tip 2, Hašimoto sindromom, multiplom sklerozom, jer protein koja se nalazi na u helikobakter pylori ima veoma sličnu strukturu kao neka ljudska tkiva i organizam koji već ima neko autoimuno oboljenje može zameniti bakteriju i svoje sopstveno tkivo i umesto bakterije početi da napada tkivo i tako još više ugroziti ceo organizam.