Osim što pomažu kod problema sa varenjem, nadutošću, dijarejom i opstipacijom, smatra se da probiotici štite od oksidativnog stresa, kao i da jačaju naš imuni sistem, mada ne postoji dovoljan broj studija koje bi za ove efekte obezbedile nepobitne dokaze. Još neka povoljna dejstva probiotika uključuju i regulisanje holesterola i krvnog pritiska, održavanje zdrave vaginalne flore, pomoć kod inflamatornih bolesti creva, gojaznosti i dijabetesa tipa 2.