Test na prisustvo antigena H. pylori u stolici predstavlja neinvazivan test, međutim, on kod nas još nije ušao u redovnu upotrebu. Ovaj test je koristan za dijagnozu infekcije helikobakterom, kao i za procenu efekta eradikacione terapije. Ukoliko je 7 dana posle završetka lečenja medikamentima rezultat pozitivan, smatra se da terapija nije uspela, dok negativan rezultat 4 nedelje posle kraja terapije znači da je infekcija uspešno izlečena.