Veliki broj različitih bakterijskih oboljenja može ugroziti normalan rad creva i sam proces varenja. Bakterijske infekcije kože, infekcija želuca helikobakterijom pilori, Kronova bolest, oboljenje zuba i druga oboljenja su razlog da se u terapiji koriste antibiotici, lekovi koji uništavaju bakterije, ali ne samo one koje su izazvale oboljenje. Zato je uz terapiju antibioticima potrebno konzumirati probiotike.
