Kada su u pitanju simptomi pilonidalnog sinusa u pitanju su veoma jak i probadajući bol cele regije koja je pod infekcijom. Dlaka koja postaje centar infekcije se nalazi između sedalnih mišića, par santimetara iznad analnog otvora, ili u skroz donjem delu kičmenog stuba. Ova regija je dodatno neprijatna jer je nepristupačna. Veoma često se infekcija zakomplikuje i dođe do pojave obimnog gnojnog sadržaja, abscesa koji prodire duboko kroz kožu u vidu konusne šupljine, otuda i naziv sinus. Može doći do spontanog pucanja ali je najpametnije obratiti se lekaru kako bi se cela regija zahvaćena infekcijom hirurški obradila.
